En bien plus de temps, l'affaire Covassi se termine comme l'affaire Bellasi 8 ans plus tôt : un individu dont les accusations contre les services de renseignements suisses sont reprises dans les médias à la hauteur d'une affaire d'État s'avère n'être qu'un vulgaire manipulateur. Toutefois, alors que l'ancien comptable du Groupe renseignement de l'État-major général est passé aux aveux après quelques heures que l'on devine difficiles avec Carla del Ponte, alors procureur de la Confédération, la fuite de l'ancien informateur du service d'analyse et prévention de la Police fédérale a fait que seule une lente enquête parlementaire a permis de la confondre.

Une fois encore, il faut constater à quel point les propos les plus fracassants sont repris par des médias avides de scandale, et pour lesquels les services de renseignements sont des cibles idéales, puisque incapables de se défendre publiquement. L'infiltration du Centre islamique de Genève et la tentative d'implication de Hani Ramadan dans des activités islamistes, "révélées" par Claude Covassi, ont fait les choux gras de plusieurs quotidiens et ont nourri tout un discours visant à diaboliser les services de sécurité suisses en général. Le rapport de délégation des commissions de gestion du parlement survient bien trop tard pour corriger les effets de ces mensonges.

En même temps, cette affaire révèle également que la dernière réforme des services de renseignements, passant par la création de plate-formes communes entre SAP et SRS (c'est-à-dire renseignement intérieur et extérieur) suite à la suppression du poste de coordinateur des renseignements créé dans la foulée de l'affaire Bellasi, n'est pas satisfaisante. Il est inconcevable que deux services puissent utiliser séparément le même informateur, qui plus est avec une interaction de la police cantonale. De toute évidence, comme d'autres rapports l'ont montré, une refonte des services de renseignements suisses reste hautement souhaitable.